gitlab-ciの記事作成ついでにgravatarを無効にする方法を記載します。
/etc/gitlab/gitlab.rbに以下を追加してgitlab-ctl reconfigureを実行してください。
gitlab_ci['gravatar_enabled'] = false
これでgravatarを使わなくなります。ただし、gitlab-ciではavatarを変更する方法がない上に連携するgitlabのavatarを変更していても取り込んではくれません。もしかすると方法があるのかもしれませんが、現時点ではそこまで探す体力はなさそうです。
では。